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PCR反應(yīng)內(nèi)參基因的三大作用
PCR反應(yīng)內(nèi)參基因的三大作用:
1. 樣品提取質(zhì)量的判斷標(biāo)準(zhǔn)
在PCR實(shí)驗(yàn)中,內(nèi)參基因首先作為判斷樣品提取是否成功的標(biāo)準(zhǔn)。當(dāng)使用逆轉(zhuǎn)錄得到的cDNA進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),如果結(jié)果為陰性,不能直接得出樣品中沒(méi)有目的基因的結(jié)論。只有當(dāng)內(nèi)參基因的CT值處于一個(gè)合理的范圍內(nèi),例如20左右,我們才能確信樣品制備沒(méi)有問(wèn)題,從而確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。
2. 目的基因表達(dá)量的計(jì)算基礎(chǔ)
在進(jìn)行相對(duì)定量PCR時(shí),內(nèi)參基因是計(jì)算目的基因表達(dá)量的基礎(chǔ)。由于每個(gè)樣品的提取效率可能存在差異,直接比較不同樣品的CT值是沒(méi)有意義的。只有將目的基因的表達(dá)量與內(nèi)參基因的表達(dá)量進(jìn)行校正后,得到的比值才具有可比性。這個(gè)比值可以量化,轉(zhuǎn)化為表達(dá)量的RQ值,為基因表達(dá)的定量分析提供了準(zhǔn)確依據(jù)。
3. 熔解曲線分析的重要參考
內(nèi)參基因的CT值也是分析熔解曲線的重要參考。當(dāng)qPCR的熔解曲線出現(xiàn)非單峰現(xiàn)象時(shí),除了考慮引物設(shè)計(jì)的問(wèn)題外,還應(yīng)檢查內(nèi)參基因的CT值。如果內(nèi)參基因的CT值過(guò)高,如超過(guò)30,同時(shí)目的基因的CT值也很大,接近40,這可能意味著模板濃度過(guò)低,增加了非特異性擴(kuò)增的風(fēng)險(xiǎn),導(dǎo)致目的片段含量不足。這時(shí),需要重新制備PCR模板以確保實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性。
內(nèi)參基因在PCR實(shí)驗(yàn)中扮演著至關(guān)重要的角色。它不僅是判斷樣品提取質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn),也是計(jì)算目的基因表達(dá)量的基礎(chǔ),并且在分析熔解曲線時(shí)提供了重要參考。正確理解和運(yùn)用內(nèi)參基因,將大大提高PCR實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性,為分子生物學(xué)研究提供堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)支持。